Data import

Data import

  • Reading of the imzML file format 
  • Import native formats from Waters timsTOF flex, Bruker Solarix FT-ICR, rapifleX 
  • Dedicated converter for Thermo raw data 
  • Automatic import of ROI annotated by expert pathologists using QuPath, Pannoramic Viewer, CaseViewer and the propriatary LipROI format 

 

  • Import of MS/MS spectra from LC-MS acquisitions. The following LC-MS formats are supported: 
    • Agilent Q-Tof(*.d): AutoMS and full scan at multiple energies of collision 
    • Waters (*.raw): MSe and MSMS (MassLynx needs to be installed) 
    • Thermo-Fisher (*.RAW): Ion-Trap and Orbitrap Data Dependent Scan, Exactive, Q-Exactive 
    • ABSciex *.wiff file format 
    • Bruker (*.d): QTof data dependent scan.